Program orientasi kampus disediakan untuk semua mahasiswa baru dan diatur dalam Peraturan Pemerintah Surat Edaran DIKTI No.253/B/SE/VIII/201. Informasi tentang program studi tersedia dalam Program Orientasi Kampus Mahasiswa Baru yang diselenggarakan oleh Universitas, Fakultas, dan Program Studi. Dalam kegiatan tersebut mahasiswa diperkenalkan dengan hak dan kewajiban mereka sebagai mahasiswa, materi tentang layanan universitas, peraturan akademik, organisasi kemahasiswaan, dan tenaga pengajar pada program studi. Mahasiswa baru juga diberikan tur kampus untuk membiasakan diri dengan ruang kelas dan fasilitas lain yang ditawarkan. Mahasiswa baru ini juga diberikan pelatihan soft skill yang bertujuan untuk mempersiapkan mahasiswa dengan atribut pekerjaannya di masa depan, antara lain kemampuan strategis, kemampuan komunikasi, kemampuan psikologis, kemampuan interaksi, keberhasilan studi di perguruan tinggi (good academic practice), growth mindset dan pengembangan karir, etika mahasiswa, kesejahteraan mental, dan pembentukan karakter. Materi membahas atribut tersebut dengan memasukkan keterampilan kewirausahaan, kepemimpinan, kreativitas, dan keberhasilan ke dalam modul pelatihan. Pelatihan soft skill dipandu dengan buku panduan soft skill mahasiswa.

Selain itu, untuk memenuhi tuntutan abad ke-21 akan penguasaan keterampilan TIK dan kemampuan menghasilkan tulisan akademis, maka peraturan nasional mengenai publikasi ilmiah wajib pada jenjang sarjana, magister dan doktoral menegaskan bahwa semua lulusan perguruan tinggi harus menerbitkan minimal satu artikel dalam sebuah jurnal akademik untuk sarjana, jurnal terakreditasi nasional untuk lulusan master, dan jurnal terakreditasi internasional untuk lulusan doktor. Peraturan Rektor No. 6/2020 bertujuan untuk mengakui artikel akademik mahasiswa sebagai bagian dari pembelajaran. Untuk mendukung mahasiswa dalam mengembangkan kemampuan menulis akademiknya, pihak universitas memberikan pelatihan penulisan akademik kepada mahasiswa baru berupa pelatihan TIK yang dilaksanakan selama dua hari di Student Internet Service UPT Pusat Komputer UNY dengan tujuan untuk membiasakan mahasiswa dengan sistem informasi akademik digital dan e-learning yang digunakan di UNY. Untuk informasi lebih lanjut terkait pelatihan ini, mahasiswa dapat merujuk pada buku pedoman akademik, anti plagiarisme dan buku saku.

Untuk mendukung kemampuan berbahasa Inggris mahasiswa, melalui Peraturan Rektor No. 1/2019 UNY mewajibkan mahasiswa untuk memperoleh skor TOEFL minimal 500 untuk mahasiswa S1 pendidikan bahasa Inggris, 550 untuk mahasiswa S2 pendidikan bahasa Inggris, 450 untuk mahasiswa S2 linguistik, dan 475 untuk mahasiswa doktoral. Tes Protefl (tes berbasis TOEFL) dilakukan untuk memeriksa kemampuan bahasa Inggris siswa. Siswa dengan skor di bawah standar diberikan pelatihan bahasa Inggris di Pusat Pelatihan Bahasa sampai mereka memenuhi standar yang disyaratkan. Pusat Pelatihan Bahasa juga menyediakan layanan terjemahan bahasa dan menyunting draf skripsi untuk mahasiswa. Layanan bimbingan akademik terutama diberikan oleh pembimbing akademik mahasiswa sedangkan layanan lain seperti konseling psikologis disediakan oleh Unit Layanan Bimbingan dan Konseling, yang dapat dilakukan baik melalui konsultasi tatap muka maupun konsultasi online. Layanan karir dan kesempatan kerja di masa depan disediakan oleh Pusat Karir, layanan kebugaran dan kesehatan fisik disediakan oleh Pusat Olahraga dan Kesehatan, layanan terkait TIK disediakan oleh Pusat TIK, dan layanan untuk visa pelajar internasional dan izin tinggal disediakan oleh Kantor Internasional. Selama program Orientasi Mahasiswa Baru, semua mahasiswa diinformasikan tentang unit-unit ini dan informasi lebih lanjut dapat diakses melalui situs web universitas.

Mahasiswa dapat mengekspresikan diri melalui berbagai organisasi kemahasiswaan yang tersedia mulai dari level program studi hingga level universitas. Selain itu, terdapat 39 unit kegiatan mahasiswa yang dapat dipilih di bidang penalaran, olah raga, kesenian, kesejahteraan dan bidang khusus.